C'est au Conservatoire de Strasbourg, dans la classe d'Elisabeth Dillenschneider, que Christophe Einhorn reçoit une médaille d'or de chant. Depuis, il se perfectionne avec Ernst Haefliger, Nicolai Gedda et Robert Dumé.

Sur scène, il se produit dans Giasone de Cavalli, Acis et Galatee de Haendel, Castor et Pollux de Rameau, Armida et L'infedelta Delusa de Haydn, Les diamants de la couronne d'Auber, L'heure espagnole de Ravel, Ariadne auf Naxos de R. Strauss ainsi que dans des compositions plus contemporaines telles que les Nouvelles histoires sacrées.

Son répertoire de prédilection reste cependant l'oratorio : le Messie de Haendel, La Creation de Haydn, Elias et Lobgesang de Mendelssohn.

Christophe Einhorn a travaillé entre autres avec René Jacobs et Rachel Yakar, Roy Goodman, Hervé Niquet, René Jacobs, Christophe Coin, Leopold Hager, Pierre Cao, Michael Schneider, Martin Gester, Joshua Rifkin, Helmuth Rilling, Michel Corboz, Marc Minkovski, Michael Hofstetter, Sigiswald Kuijken, Christian Zacharias et Andrew Parrott.